Bioinformatyka

Program studiów
II stopnia

Program studiów został skonstruowany w sposób modułowy.

Pierwszy semestr dostarcza solidnych fundamentów wspólnych dla wszystkich studentów — niezależnie od tego, czy kandydat ma wykształcenie przyrodnicze, czy informatyczne. Od drugiego semestru studenci wybierają jedną z trzech specjalizacji, a dodatkowo mogą dobierać przedmioty z pozostałych ścieżek, elastycznie kształtując swój profil kompetencji.

Semestr I — fundamenty

Pierwszy semestr wyrównuje i buduje bazę niezbędną do dalszej pracy specjalizacyjnej. Program obejmuje programowanie w języku Python, pracę w środowisku Linux z systemami kontroli wersji, metody matematyczne i statystyczne stosowane w bioinformatyce oraz wprowadzenie do zagadnień biologicznych. Wszystkie zajęcia łączą wykład z ćwiczeniami praktycznymi, tak aby od pierwszego dnia student pracował z realnymi danymi i narzędziami.

Semestr II i III — specjalizacje

Studenci realizują przedmioty w ramach wybranej specjalizacji, uzupełniając je dwoma przedmiotami obieralnymi z pozostałych ścieżek w każdym semestrze:

Bioinformatyka kwasów nukleinowych

Specjalizacja przygotowuje do pracy z danymi sekwencjonowania wysokoprzepustowego (NGS). Program obejmuje pełen cykl analizy danych genomowych i transkryptomicznych — od kontroli jakości surowych odczytów, przez mapowanie i wykrywanie wariantów, po analizę ekspresji genów (RNA-seq) i interpretację wyników w kontekście diagnostycznym i badawczym. Absolwent jest przygotowany do pracy w laboratoriach, centrach genomicznych i zespołach zajmujących się onkologią spersonalizowaną czy diagnostyką chorób rzadkich.

Bioinformatyka strukturalna i proteomika

Specjalizacja koncentruje się na strukturze i funkcji białek — kluczowym obszarze dla projektowania leków i inżynierii białek. Program obejmuje przewidywanie struktur białkowych (w tym podejścia oparte na uczeniu głębokim, takie jak AlphaFold), dokowanie molekularne, wirtualny screening, dynamikę molekularną oraz proteomikę obliczeniową. Absolwent jest przygotowany do pracy w działach R&D firm farmaceutycznych, zespołach biologii strukturalnej oraz firmach oferujących usługi modelowania molekularnego.

Bioinformatyka stosowana i transfer technologii

Specjalizacja łączy kompetencje techniczne z wiedzą biznesową. Program obejmuje zarządzanie projektami technologiczno-badawczymi, ochronę własności intelektualnej, regulacje dotyczące wyrobów medycznych, modele biznesowe w biotech oraz budowanie produktów bioinformatycznych — oprogramowania, platform SaaS i usług analitycznych. Absolwent jest przygotowany do ról kierowniczych: project managera, product ownera, kierownika działu bioinformatyki, a także do zakładania własnych firm komercjalizujących rozwiązania bioinformatyczne.

Semestr IV — zaawansowane technologie i praca magisterska

Ostatni semestr integruje wiedzę ze wszystkich ścieżek. Studenci realizują przedmioty wspólne z zakresu rozwiązań chmurowych i Big Data, uczenia maszynowego i głębokiego w bioinformatyce oraz zarządzania procesami analizy danych. Kulminacją programu jest praca magisterska.

Kluczowy element wyróżniający: AI w każdym przedmiocie

Narzędzia sztucznej inteligencji są zintegrowane z programem przekrojowo, od analizy sekwencji, przez modelowanie białek, po automatyzację procesów analitycznych. Program traktuje AI nie jako odizolowany moduł, lecz jako naturalne narzędzie pracy współczesnego bioinformatyka.